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赛福基因:基因数据解析与精准医疗

2022-05-10 责任编辑:未填 浏览数:26 天涯医药网

核心提示:方形突变分割线“人类一切疾病,除创伤之外,能够皆跟遗传基因密不可分。”通知记者这句话的,是赛福基因的创始人兼CEO余伟师。赛福基因的创始人兼CEO余伟师赛福基因是一家基因数据分析解读及基因诊断产物的研发服务

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“人类一切疾病,除创伤之外,能够皆跟遗传基因密不可分。”通知记者这句话的,是赛福基因的创始人兼CEO余伟师。


赛福基因的创始人兼CEO余伟师

赛福基因是一家基因数据分析解读及基因诊断产物的研发服务商。与其他基因检测相关企业分歧,赛福基因主打的第一个产物不是当下热点的轮回肿瘤DNA(ctDNA)检测,不是无创产前,而是现阶段海内少有人涉足的神经性疾病——癫痫。

余伟师通知记者:“别看此刻癫痫的精准医疗产物市场上借十分稀缺,但那是继癌症之后最有能够实现精准医疗的疾病,咱们愿望团队专家的尽力能真正资助到临床大夫对患者的正确诊疗。”

现阶段,全世界约莫有6500万人遭到癫痫困扰,此中80%生涯正在发展中国家。中国的癫痫病例占人口总数的千分之七,濒临900万人,而且每一年另有40万的新增病例,更严峻的是,跨越50%的患者是儿童。“以是癫痫的正确诊断跟无效医治,火烧眉毛。”余伟师道这句话的时间,显得非分特别严正。

64位博士,学霸团队

“实在刚起头树立这个团队的时间,是因为看到人类疾病的复杂性,而经由过程一己之力根本无法办理多大的问题,只有联结更多的能人材能来做点甚么,把根底技巧转化为临床使用。”余伟师回忆起本人的创业进程。

2011年,博士结业的余伟师进入美国国立卫生研究院(NIH)处置基于再生医学引诱干细胞的表观遗传学研讨。而在此之前,余伟师便始终处置肿瘤、疾病与基因相关研讨,探求基因旌旗灯号通路与疾病、肿瘤发生开展的接洽。跟着研讨的深化,对基因与疾病的接洽有了更深的意识。因而他起头思虑:若何才气把这些技巧用到临床上,对临床使用有所资助。

机缘巧合,来美国两年之后,余伟师意识了几位情投意合的伴侣。此中便有包罗了此刻公司的结合创始人刘湘涛和其他核心成员。其时一行人正在谈起基因测序的时间,以为将来团体基因组测序本钱必定会降低,而随之发生的海量数据的高效高质量剖析跟解读将会面对极大应战。“各人念,正在美国咱们有那么多华人博士始终是所在机构的技巧攻坚脚,若是能把各人群集起来是否是可以发生更大的化学反应。”余伟师默示。接下来,他们几人便本人集资,将团队成员的血液送来测序,然后停止实战数据解析。此刻想来,也恰是其时那股闯劲,才渐渐群集起明天的团队。

2013年,团队雏形树立实现。虽然只有五个人,但涵盖了生物信息学、份子医学、遗传学等多个学科。“其时大多数时间借只能拿一些公然的基因数据做摸索,停止一些模拟训练,看能不克不及对未来的临床有所资助。”余伟师回忆讲:“其时是有这么一个愿景,借不想到可以做成公司。”

大概是荣幸,大概是技巧够扎实。不到三个月,团队便接到了第一个Case。广东中山病院托人找到余伟师,愿望他们能对一名患者的齐外显子测序跟RNA-Seq数据停止剖析。不泄漏病人详细患了甚么癌症,也不病人的任何其他信息,完整是一场盲测。

“其时我正在念,既然接管了应战,那便尽最大尽力尝尝吧。”抱着如许的心态,余伟师跟团队起头了数据深度剖析跟解读。思量到癌症医治工夫节点的重要性,几个人不眠不休的赶了一周,终于实现了剖析讲述。终极结果显示:病人男,35岁,肠癌患者,临床诊断成果完全符合!

但真正让余伟师镇静的,实在是病人的靶向药物位点的检测成果。讲述显现,病人的几个位点是与其时的临床靶向药物相关的。也就是说,有了这个讲述,大夫可以依据下面的发起给病人间接停止靶向医治。“能用于临床的发明,比之前技巧研讨的发明加倍让人冲动。”回忆起第一单,余伟师仍是显得很冲动。

也就是阿谁时间,余伟师感触感染到:本人此刻做的工作,是对临床有用的。但另一方面他又正在思量,这么一个病人几个人便逐日每夜的搞了一个礼拜,那若是此后患者多了怎么办呢?思虑之后,余伟师决意:要扩展团队,更要树立一个能降低人工成本的基因数据智能解析平台!

接下来的工夫,余伟师应用周末的工夫起头无意识的来列入各类投资创业举止,打仗医疗范畴跨学科的专业人士,整合资源,壮大团队,2013年被选为NIH-frederick中国门生学者联谊会主席,并兼任美国华盛顿青年创业协会会长,美国华人专业联合会理事。颠末2年的工夫余伟师正在美国结合了64位华人博士构成了一个专家团队,耗时两年工夫构建了一个独占的疾病、基因、药物关系数据库。现阶段,这个数据库中包罗一万多种疾病相关的基因与基因突变位点信息,而且借正在不休的及时更新。

2015年,中国的创业掀起高潮,余伟师决意率领团队回国创业建立公司。他抛却了正在联邦政府部分绝对不变的事情,抛却了正在提交资料的EB1A绿卡请求,抛却了一百多万美元的NIH当局经费跟升职时机报名列入了微软加速器的寰球名目海选,并以2%的录取率,从1500家企业中怀才不遇,当选北京微软加速器。一年过来,团队博士有跨越10人连续全职出来,波及正在癌症范畴、遗传疾病、生物信息学跟遗传征询多个范畴,这是其他团队正在短时间内难以复制的劣势。

数据分析是瓶颈,也是将来标的目的

“我读博士的课题是肿瘤基因旌旗灯号通路研讨,阿谁时间很少波及二代测序跟生物信息,我做的满是一代测序相关的试验,有时候会下载一些收集公然二代测序数据,但难于找到适合的数据分析师帮助,本人做数据处理又非常复杂。”余伟师认为,数据分析必然会是未来基因检测的难点跟关键所在。

“正在NIH的时间,资源皆是同享的,有本人的测序中间跟剖析团队,可以时常跟他们停止交换并实现剖析数据的解读,从阿谁时间起头便对二代测序数据分析跟解读深有体会。”余伟师默示。其时二代测序正在美国曾经是成熟的技巧,正在中国借处于早期阶段。思量到基因检测将来能够呈现的瓶颈,也联合本人的劣势,余伟师进一步坚决了以二代测序基因数据分析跟解读为创业标的目的。

自动化平台,助力癫痫精准诊疗

“回国当前,咱们借不本人的实验室,像肿瘤如许跟工夫竞走的疾病范畴借没有具有客观条件。”余伟师默示:“再加上肿瘤复杂程度,现阶段靶向药物十分有限,市场上那类型产物太多,有良多十分优异的企业也奔忙正在了后面,咱们取舍了与海内肿瘤医院协作做更深层次的针对咱们中国人族群的肿瘤产物研发。”

早正在美国的时间,咱们对神经内科疾病特殊是癫痫便有必然的研讨堆集,对咱们来讲,这是劣势。是以咱们起首推出了癫痫临床筛查、诊断跟医治联合产物——安晶。安晶的推出,是中国癫痫精准诊断跟医治从零到一的冲破。最大的特色是将齐基因齐外显子组检测使用到癫痫的诊断诊疗。

癫痫的病发因素良多,此中60%以上皆是遗传决意。现阶段,海内还没有有一家公司将癫痫的基因、病因跟药物相关性做一个体系深化的研讨并开辟成产物。“从这一点看,咱们存在先发劣势。”余伟师默示。

传统的基因包(Gene Panel)只能筛查出已知位点渐变惹起的疾病,对原发性未知渐变则显得有力。安晶的冲破便在于将齐基因检测使用到癫痫临床检测上,创始了癫痫诊疗的新形式。不只能筛查出已知位点渐变疾病,也可以用于原发性未知渐变惹起的癫痫疾病筛查与正确诊断,覆盖面积更广,阳性检出率也进步了50%。经由过程对癫痫机理更深化的相识,可以为临床给药供给更多的参考价值,能更好的帮助临床诊疗。

本年10月,公司进行了基因数据智能解析平台发布会,实现了安晶产物的自动化剖析流程。

平台经由过程对数据库停止自动征采比对,可对已知位点停止自动化数据过滤婚配,自动天生检测讲述;关于文献中曾经呈现的未知位点,咱们计划构建的计分体系将自动对这些位点停止挑选,然后经由过程人工校验的方法实现。


另外,更大的亮点在于平台的两重危险管理系统,从基因程度跟渐变位点程度对患病危险做出更正确的预判。余伟师泄漏,平台存在机械学习才能,跟着样本量增长,风险管理的准确性会随之加倍精准。

“后续咱们借将对平台调剂进级,进一步提高美妙度跟利用便捷性做好用户体验,终极愿望经由过程手机便能实现接见。”余伟师默示:“这个进程中咱们也始终皆正在跟临床大夫相同,也会把临床大夫的反应增长到内里。”

协作临床,深化疾病摸索

现阶段,安晶作为第三方检测的B2B2C产物,次要与临床大夫协作。这个进程中,技巧跟准确性很紧张,起首要失掉临床大夫的承认,才会有患者去做检测数据分析,大夫才会把讲述视为临床诊疗的根据。余伟师默示:“咱们的底层技巧架构是其它公司很难具有的,这类对数据专业的剖析跟解读,对临床有很好的指导作用。”

“为了树立更好的癫痫诊疗产物,咱们正在底层神经系统的技巧研发会不休投入,并且也会接收更多专业人才。”余伟师通知记者。他念做的不单单是癫痫的诊断,更多的是对基因位点跟疾病接洽深层次的摸索。现阶段,公司曾经与一些专家树立协作,愿望经由过程对样本的堆集,可以发明新的生物标志物。那不只存在现阶段诊断意思,更是将来临床医治要思量的标的目的。

另外,公司借正在姑苏树立了分公司,筹划推广花费级健康人基因检测产物全晶。全晶次要针对安康人群的庞大疾病筛查跟安康经管。余伟师认为,虽然从现阶段来说花费级基因检测并不是刚需,但极有能够是下一个花费科技。

当中国人群的基因数据堆集到必然的时间,经由过程基因检测对疾病的精准定位跟对健康人的疾病防备与安康经管将会更有把握。那一个须要工夫进程,应用基因科技打仗一切消费者而且从实质上去影响他们,是件没有简单也是十分了不得的工作。”余伟师默示。

下一步,公司愿望把安晶等产物推广到更多的病院,资助更多的临床患者。同时,余伟师借愿望可能树立更专业的发卖团队,扩展产物渠道。正在产物研发上,将继承安晶产物的进级优化,同时借愿望推出针对自闭症跟老年痴呆症等相关临床诊疗产物,将一个又一个困扰跟熬煎人类安康的疾病实现精准化诊疗。

公司于本年仲春,实现了天使轮融资,由创见本钱、将门创业、朗玛峰创投三家机构配合投资,下一轮融资已于数日前启动。

文|周梦亚

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