Science：打破传统！癌症基因组中的突变“热点”不一定会推动癌症的生长！
麻省总医院(MGH)癌症中心研究人员的一项研究发现，特定的基因突变经常出现在特定的肿瘤中，但与通常的假设相反，这一事实可能并不意味着这种突变推动了癌症的发展和进展。他们发表在期刊《Science》上的文章描述了DNA单链如何折叠成所谓的“发夹”结构，这种结构对许多癌症中表达的基因编辑酶的突变高度敏感。
然而，许多这些突变“热点”发生在与癌症完全无关的基因中，包括基因组的许多非编码区。
研究人员表示，一个典型的癌症基因组将有5到10个驱动突变和数千甚至数百万个“乘客”突变。一直认为，如果在许多不同的癌症患者身上发生完全相同的突变，肯定会给癌细胞带来健康优势。虽然基于复发识别癌症驱动因素的方法已经成功，但也有可能基因组中的某些位置容易发生突变。
Cell：非吸烟肺腺癌的基因组重排早在癌症确诊前30年就已存在
在一项新的研究中，来自韩国高等科学技术研究院(KAIST)和首尔国立大学等研究机构的研究人员发现，早在儿童和青少年时期的灾难性基因组重排会导致不吸烟者在晚年患肺癌。这一发现有助于解释一些非吸烟相关的肺癌是如何形成的，相关研究成果发表在《细胞》杂志上。
这些研究人员证实，不吸烟者的基因融合大多发生得更早，有时早在儿童或青少年时期，平均而言，发生在肺癌诊断前30年。
这项研究表明，这些携带致癌种子的突变肺细胞已经休眠了几十年，直到其他许多突变完全积累后，才进展为肺癌。这是首次揭示肺腺癌基因组结构变异景观的研究。
肺癌是世界上癌症相关死亡的主要原因，肺腺癌是最常见的肺癌类型。大多数肺腺癌与长期吸烟有关，但约有四分之一的肺腺癌发生在不吸烟者身上。确切地说，人们仍然不知道是什么使不吸烟者患上这种癌症。
Nature：揭示病毒基因组如何包装在病毒衣壳内部
在一项新的研究中，来自芬兰赫尔辛基大学和英国牛津大学等研究机构的研究人员首次破译了病毒基因组如何包装在病毒衣壳中。相关研究成果发表在《自然》杂志上。
研究人员Juha Huiskonen说，“这项研究的动机是增加我们对病毒复制的基本了解，但从长远来看，它可能有助于治疗病毒性疾病。”这一突破性成果是利用低温电子显微镜技术取得的。近年来，低温电子显微镜技术彻底改变了结构生物学，即旨在了解生命分子在原子水平上如何发挥作用的生物学领域。
这些研究人员使用强大的电子显微镜拍摄了数千张高纯度病毒的图像。然后将这些图像组合起来，形成一个三维结构模型，这使得他们不仅可以观察到构成病毒衣壳的蛋白质，还可以首次追踪到蛋白质衣壳内部的核酸基因组。他们观察到病毒基因组形成了一种结晶液体，即高度包装有序的液体状态。
Nature：重磅！科学家成功解析出转移性乳腺癌的基因组特性！
近日，在国际期刊《自然》上发表的研究报告中，来自巴塞尔大学等机构的科学家成功描述了转移性乳腺癌的基因组特征。相关研究成果可为阐明乳腺癌转移的分子机制和开发新的转移性乳腺癌治疗方法提供新的思路和研究基础。
转移是乳腺癌患者死亡的主要原因。许多研究分析了早期乳腺癌的基因组特征。但有研究表明，癌症从早期向晚期过渡时会获得许多基因组的改变，乳腺癌早期的基因组特征不一定代表癌症致死的基础。
因此，在这项研究中，研究人员分析了617例转移性乳腺癌样本的体细胞变化图。研究人员指出，当与癌症基因组图谱中的早期乳腺癌样本进行比较时，他们发现9个驱动基因在转移性乳腺癌中频繁突变，这些基因表达激素受体，但HER2水平较低。这些驱动基因包括TP53、ESR1、GATA3、KMT2C、NCOR1、AKT1、NF1、RIC8A和
Nature：新研究揭示胚胎发育早期基因组的组装特征
最新研究表明，卵母细胞受精后会立即出现DNA活性区和非活性区的分化，这种现象甚至在基因被激活之前就已经出现。这项研究将有助于更好地理解单个受精卵发育成由许多不同细胞类型组成的完整有机体的机制。相关结果发表在《自然》杂志上。
受精卵最终会发育成一个由万亿个细胞组成的具有多种功能的完整有机体。虽然这些细胞有不同的功能，但所有这些细胞中的DNA是相同的。细胞的特征由基因组的特定表达谱决定。但是决定机制并不清楚。DNA在细胞核中不是随机分布的，它们在空间上可以分为活跃区和非活跃区。不同的区域被一种叫做叶片相关区域的结构所分隔。
Cell：科学家鉴别出维持细胞基因组完整性的新型DNA修复机制
日前，在国际期刊《细胞》上发表的一篇研究报告中，来自范德堡大学的科学家确定了一种新的DNA修复机制，以维持基因组的完整性。根据研究人员的说法，这种机制是由一种名为HMCES的蛋白质启动的，这是之前研究人员确定的200多个蛋白质家族之一。这些蛋白质属于特殊的分子机器，可以在细胞分裂时帮助DNA复制。一些蛋白质被用于与DNA复制相关的功能，而一些蛋白质，包括HMCES，还没有发现这种功能。
研究人员科尔特斯(Cortez)表示，每种生物都有类似HMCES的蛋白质，比如人类和细菌。在这项研究中，我们消除了细胞中的HMCES基因，以寻找细胞复制中的问题，但研究人员没有发现任何问题，即缺乏HMCES的细胞仍然可以正常分裂和复制DNA当研究人员用受损的DNA挑战这些细胞时，他们发现HMCES对维持细胞健康至关重要。
Cell：发现一种将癌症进展与基因组不稳定性关联在一起的新型生物标志物
我们的DNA经常受到攻击。这种包含我们遗传信息的分子很容易受到一切因素的影响，从环境因素(如辐射)到我们呼吸的空气和我们吃的食物中的化学物质。基因组不稳定会导致遗传病、慢性病和癌症易感性。
在一项新的研究中，以色列特拉维夫大学的研究人员确定，一种名为ubiquilin-4的蛋白质水平升高，成为基因组不稳定性的新生物标志物。他们发现泛素-4参与保护基因组免受DNA损伤，但过多的泛素-4是有害的。
当肿瘤细胞中泛素-4的水平增加时，这些肿瘤细胞更容易出现基因组不稳定，从而加速肿瘤的进展，并使其对常见的癌症治疗产生耐药性。相关研究成果近日发表在《细胞杂志》上。
Nature：改写教科书！中国科学家阐明保护卵母细胞独特表观基因组的新型机制！
在哺乳动物中，雌性卵母细胞的数量往往是有限的，卵母细胞有一套独特的表观基因组，其甲基化程度是精子的一半，卵母细胞也是分化程度最高的体细胞。到目前为止，研究人员还不知道DNA甲基化的这种独特的调控模式及其相关功能。
近日，在国际期刊《自然》上发表的一篇研究报告中，中国科学院生物物理研究所朱冰教授的研究团队发现了一种新的DNA甲基化调节剂——Stella，其在体细胞中的异位过表达可以通过干扰DNA甲基化调节剂UHRF1的功能，诱导DNA完全去甲基化。
在这篇论文中，研究人员揭示了Stella如何通过一个主动的核输出过程将调控因子UHRF1从细胞核中分离出来，而Stella缺失导致的UHRF1功能障碍会导致卵子发生过程中异常DNA甲基化的积累。相关研究发现，第一个调控因子可以保护卵母细胞基因组的特殊甲基化状态。
Cell：挑战常规！真核生物基因组周期性竟由突变导致
在一项新的研究中，来自西班牙巴塞罗那IRB的研究人员研究了3000多个人类肿瘤样本中的突变分布，并观察到这些突变也是每10个DNA碱基对累积一次。相关研究成果发表在《细胞杂志》上。
研究人员Oriol Pich解释说，“通过研究不受自然选择影响的基因组区域的突变分布，我们发现在构成核小体一部分的DNA中，每10个碱基对存在显著的周期性。”突变是周期性发生的，因为核小体中包装的DNA的结构有利于容易受损和修复的区域的出现。因此，这些区域更容易发生突变。
接下来，这些研究人员将注意力转向人类和植物中代代相传的突变。他们发现这些基因突变也是每10个碱基对累积一次。鉴于这项关于核小体如何影响DNA突变的新发现，这些研究人员推测，这也可能解释真核生物基因组序列中的这种神秘周期性。
Cell：华大基因主导的最大规模中国人基因组测序结果揭示独特的病毒感染模式
在一项新的研究中，通过分析世界上最大的涉及中国各地141，431名孕妇的基因组数据，深圳华大基因和中国其他研究机构的研究人员发现了基因和生育结果之间意想不到的关系(包括双胎妊娠和女性首次怀孕的年龄)。这一分析也使这些研究人员能够重建近代以来中国不同民族的迁徙和通婚情况，并有望帮助识别使人易患传染病的基因。相关研究成果发表在《细胞杂志》上。
这些孕妇提供了血液样本来检测胎儿染色体异常，主要是唐氏综合征。这项技术被称为无细胞胎儿DNA检测，是一种非侵入性的产前检测方法。鉴于他们未出生的孩子的DNA漂浮在孕妇的血液中，这种技术是可行的。通过快速鸟枪测序，实验室可以破坏血液中所有自由浮动的DNA，并测序大小正好适合诊断唐氏综合征的DNA片段。
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