肝癌死亡率居世界第二，但治疗方案仍然有限。了解更多关于这种癌症的遗传原因，并确定潜在的新治疗靶点。由癌症基因组学主任和人类基因组测序中心(HGSC)教授David Wheeler领导的全球基因组学研究小组。对全世界363例肝癌进行了分析。通过DNA甲基化、RNA转录和蛋白表达分析肝癌患者的基因组突变和表观遗传学改变。这项研究发表在几天前的《细胞》杂志上。
作为大型癌症基因组图谱计划(TCGA)的一部分，这项研究工作是首次大规模多平台分析，以观察肿瘤的多个维度。“过去，在肝癌方面已经做了很多研究，但它们主要局限于肿瘤的一个方面：基因组突变。现在，研究人员可以通过观察肿瘤的各种分子特征，在分子水平上对肿瘤手术有更深入的了解，”惠勒说。
“我们在贝勒有一个非常活跃的肝癌社区，因此我们有很好的机会与他们合作，并受益于他们对肝癌的见解。”惠勒说。在肝脏的许多关键功能中，肝细胞对白蛋白和尿素的产生至关重要。找出肝癌细胞如何关闭这些功能以实现自身肿瘤生长和细胞分裂是疯狂的。
贝勒大学分子细胞生物学助理教授、该研究的合著者Karl-Dimiter Bissig指出：“有趣的是，我们发现氨甲酰磷酸合酶高度甲基化下调，而细胞质氨甲酰磷酸合酶II上调。这可能是肝癌的合成代谢需要，重新编程谷氨酰胺途径有利于嘧啶产生，从而潜在地促进DNA复制，对癌细胞有益。”
多种数据平台与临床数据的结合，使研究人员能够将肿瘤分子特征与临床特征相关联，从而更深入地了解其分子和基因的作用，并帮助设计新的治疗方法。
人类基因组测序中心主任理查德吉布斯博士说：“这是一项分析癌症发病率增加的杰出研究，尤其是在德克萨斯州。值得注意的是，对预测患者预后的基因表达特征的观察是这项研究的显著成果。该结果非常有潜力，标志着这种癌症治疗的转折点。”HGSC也是该项目的DNA序列生产中心。
参考数据
Adrian Ally等.肝细胞癌的全面和综合基因组表征，细胞(2017)。DOI: 10.1016/
文章原标题：细胞：让我们在“基因”和“症状”之间画一个等号吧！寻找新疗法！